Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms