Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPAP49450 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms