Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK8P49336 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK8P49336 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK8P49336 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK8P49336 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms