Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP5P45974 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP5P45974 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP5P45974 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP5P45974 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP5P45974 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms