Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGM1P36871 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGM1P36871 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGM1P36871 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGM1P36871 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms