Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms