Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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