Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms