Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CMPK1P30085 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms