Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRMP28827 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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PTPRMP28827 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
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