Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMBRP28336 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMBRP28336 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMBRP28336 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMBRP28336 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMBRP28336 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMBRP28336 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms