Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ABCD3P28288 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms