Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PLNP26678 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PLNP26678 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms