Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB7P26010 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms