Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME2P23368 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME2P23368 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME2P23368 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms