Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT1P21579 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT1P21579 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT1P21579 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT1P21579 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT1P21579 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms