Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGCP20142 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGCP20142 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PGCP20142 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGCP20142 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGCP20142 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms