Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLT1P17948 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLT1P17948 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLT1P17948 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLT1P17948 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLT1P17948 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLT1P17948 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLT1P17948 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms