Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms