Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms