Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCL3P10147 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCL3P10147 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms