Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms