Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB7P09629 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms