Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms