Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms