Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP19O94966 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP19O94966 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP19O94966 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP19O94966 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP19O94966 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP19O94966 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms