Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms