Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RPS6KA4O75676 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA4O75676 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms