Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms