Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD6O75340 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms