Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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