Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms