Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOCS6O14544 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms