Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms