Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C2AO00443 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms