Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms