Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms