Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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