Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms