Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms