Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LIPT2A6NK58 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms