Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MTMR11A4FU01 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR11A4FU01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms