Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms