Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U3KQ87 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U3KQ87 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U3KQ87 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms