Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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