Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UTP11Q9Y3A2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms