Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAB39Q9Y376 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms