Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms