Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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