Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF8Q9UPP1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms